通常在线水质检测仪所需的主要维护是清洗采样管道和取样舱。

一般清洗这些部位的简单方法是加大阀门开度，增加样水的流量，或者打开安装在取样管路中的反冲洗管路的阀门进行清洗。

但在清洗原水、模拟斜管、沉淀水仪表的取样舱时，仅用这种方法是不可能完成清洗的，更多的是需要直接清洗取样舱和探头。

另外，在对某些型号的余氯检测仪进行维护时，因其取样舱里装有保持电极表面不被氧化的石英砂，所以还要注意取样舱中存余石英砂的数量。

此外，在整个清洁过程中，应注意操作规范，避免因情节操作不规范导致仪器出现损坏。

在对在线水质检测仪进行清洗时还应对清洗周期进行把握。根据不同情况下，多功能水质检测仪的实际情况进行定期清理，以避免因清洁不及时导致多功能水质检测仪的使用出现误差。