地表水水质监测站常用的监测仪器和监测项目应根据水源地的主要用途和水质自动监测系统的监测目的而定。通常可以自动监控的项目如下：

1、常规指标：水温、电导率、pH值、溶解氧、浊度、氧化还原电位、盐度、悬浮物等。

2、盐类和有机污染综合指标。高锰酸盐指数、化学需氧量、总有机碳、生化需氧量、总需氧量、紫外线、总磷、总氮、氨氮、硝酸盐氮、石油、硫酸盐、氯化物、活性氯、氟化物等。

3、水污染物。如金属离子、氰化物、酚等。

4、水质生物指标。如大肠菌群、叶绿素等。

5、水文气象参数。如流量、水位、温度、湿度等。

水质监测站的运行由专用控制设备控制。该控制系统包括硬件和软件。硬件通常由PLC程序控制器或工业控制计算机和自动执行部件组成。软件包括可编程组态王软件或机器语言编程应用软件等。控制和数据采集系统完成的主要功能是系统运行过程控制、数据采集、处理和存储等。

水质自动监测站的信息传输方式有有线、无线、卫星通信等，水质自动监测站仪表的监测数据、报警信号和状态信号可自动上传到管控中心，管理控制中心还可以通过拨号方式连接水质自动监测站控制器，调取水站数据，下发相关指令，控制设备运行。

监测站房及配套设备，包括站房、供电设备、空调设备等。